軍工保密檢查（以二級保密資格為例）主要是指軍工單位保密工作機構依據國家保密法律、法規和相關標準與指南，采取相應的管理和技術手段，對各類涉密人員保密責任制落實和規章制度執行情況進行檢查的活動。
一、檢查內容
1、全面檢查
保密辦公室依據《武器裝備科研生產單位二級保密資格評分標準》要求和單位保密委員會的工作部署，對保密工作涉及的全部內容，包括保密責任、歸口管理、保密組織機構、保密制度、保密管理、監督與保障等六個方面，即243小項進行檢查的活動。
2、專項檢查
保密辦公室對各歸口管理部門、各涉密人員日常工作中貫徹執行國家、上級主管部門和單位有關規定，落實保密工作計劃和措施的情況，或保密工作中的重點、難點工作進行的專項檢查。
3、涉密部門檢查
包括對涉密部門負責人檢查和涉密部門自查。分管保密工作負責人每季度對涉密部門負責人保密責任履行情況進行檢查；涉密部門自查是部門自行組織的對所屬人員遵守保密規章制度和保密工作職責履行情況的自檢自查。
二、檢查時間
全面檢查：每半年組織一次。
專項檢查：結合工作實際每年開展1-2次。
涉密部門檢查：每季度進行一次。
三、檢查方法
聽取匯報：
聽取被檢查部門介紹保密管理工作情況。
查閱資料：
查看被檢查部門管理制度、管理工作檔案和相關記錄。
談話訪問：
以座談會或個別談話方式了解保密工作情況。
知識測試：
以書面形式了解涉密人員對保密知識的掌握程度。
技術檢測：
采用技術檢測工具或設備檢查制度運行的可靠性。
現場檢查：
查看保密管理制度和安全防護措施的落實情況。
四、檢查步驟
1.全面檢查
第一步：保密辦公室確定保密檢查的內容、時間和形式，并制定工作計劃。
第二步：檢查組按計劃對涉密部門進行現場檢查，填寫《半年保密監督檢查表》，記錄檢查情況。向存在問題的部門發出整改通知，填寫《保密檢查問題整改通知書》，由受檢部門和檢查人雙方簽字確認。
第三步：各部門針對檢查組開具的整改通知，及時分析問題原因，制定整改措施并抓好落實，將整改情況反饋給保密辦公室，并填寫《保密檢查問題整改反饋表》。
第四步：保密辦公室對整改情況進行跟蹤驗收。
第五步：檢查完成后，保密辦公室總結和分析保密檢查及整改情況，并將有關情況和分析結果向保密委員會報告，必要時，向單位進行通報。
2.專項檢查
第一步：保密辦公室結合單位保密工作實際，制定專項檢查計劃。
第二步：按計劃組織實施，如實記錄檢查情況。
第三步：對檢查出的問題，保密辦公室向問題所在部門發出《保密檢查問題整改通知書》，提出整改意見和整改期限。
第四步：問題責任人或部門負責人應及時分析原因，制定整改措施，按期整改，并填寫提交《保密檢查問題整改反饋表》。
第五步：檢查結束后，保密辦公室對檢查工作進行總結，并將檢查和整改情況報告保密委員會。
3.涉密部門檢查
涉密部門負責人檢查：
分管負責人每季度對涉密部門負責人的保密責任履行情況進行檢查，填寫《涉密部門負責人季度檢查表》。
涉密部門自查：
第一步：各涉密部門負責人每季度針對本部門日常科研生產及管理中的保密工作進行自查，對檢查發現的問題提出整改要求，并對整改情況進行跟蹤檢查。
第二步：將自查情況及存在問題的整改情況在《涉密部門季度保密自查表》中如實記錄，交保密辦公室備案。保密辦公室對各部門的自查工作進行指導和監督檢查。
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